⒈ 古代宗廟中藏神主的石函。

引《左傳·莊公十四年》“先君桓公命我先人，典司宗祏” 晉杜預注：“宗祏，宗廟中藏主石室。”
北魏酈道元《水經注·河水四》：“又東南逕司馬子長墓北，墓前有廟，廟前有碑。 永嘉四年， 漢陽太守殷濟瞻仰遺文，大其功德，遂建石室，立碑樹桓。”
《新唐書·禮樂志三》：“建石室於寢園，以藏神主，至禘祫之歲，則祭之。”

⒉ 指石造的墓室。

引《宋書·禮志二》：“漢以后，天下送死奢靡，多作石室、石獸、碑銘等物。”
唐楊炯《為薛令祭劉少監文》：“石室兮沉沉， 蓬萊山兮寂又陰。”
宋葉適《朱文昭母楊氏挽詞》：“古今歸石室，筆削紀萱堂。”

⒊ 泛指石造之室。比喻極堅固的防守設施。

引《三國志·吳志·賀邵傳》：“近劉氏據三關之險，守重山之固，可謂金城石室，萬世之業，任授失賢，一朝喪沒，君臣係頸，共為羈僕。”

⒋ 古代藏圖書檔案處。

引《史記·太史公自序》：“周道廢， 秦撥去古文，焚滅《詩》《書》，故明堂石室，金匱玉版，圖籍散亂。”
晉葛洪《抱樸子·內篇自序》：“雖不足以藏名山石室，且欲緘之金匱，以示識者。”
南朝梁劉勰《文心雕龍·史傳》：“閲石室，啟金匱，抽裂帛，檢殘竹，欲其博練於稽古也。”
宋司馬光《神宗皇帝挽辭》之二：“它年紬石室，光大繼皇墳。”
清錢謙益《李自華父可守贈承德郎刑部山東清吏司主事制》：“為觀於石室，視我贊書。”

⒌ 巖洞。

引漢趙曄《吳越春秋·勾踐入臣外傳》：“吳王知范蠡不可得為臣，謂曰：‘子既不移其志，吾復置子於石室之中。’ 范蠡曰：‘臣請如命。’”
三國魏曹植《苦思行》：“鬱鬱西岳巔，石室青青與天連。”
《晉書·嵇康傳》：“康又遇王烈，共入山……又於石室中見一卷素書，遽呼康往取，輒不復見。”
唐于鄴《贈隱者》詩：“石室掃無塵，人寰與此分。”
宋蘇軾《游桓山記》：“登桓山，入石室。”
陳毅《七星巖》詩：“石室嘆鉆天， 景福祕地藏。”

⒍ 指傳說中的神仙洞府。

引漢劉向《真君傳》：“赤松子者， 神農時雨師也……數往崑崙山中，常止西王母石室中，隨風雨上下。”
晉陶潛《搜神后記》卷一：“始興機山東有兩巖，相向如鴟尾。石室數十所。經過，皆聞有金石絲竹之響。”
《剪燈新話·申陽洞記》：“更前百步，豁然開朗，見一石室，榜曰：申陽之洞。守門者數人，裝束如昨夕廟中所睹。”
清徐喈鳳《會仙記》：“秋鴻以扇拂壁，忽豁大門，肅丹忱入。洞中石室，別有天地。”
黃侃章炳麟《游仙聯句》：“石室坐王母，旁揖喬松儔。”

宗廟中藏放祖先神主的屋室。